Skip to content

AFNI/NIfTI Server

Sections
Personal tools
You are here: Home » AFNI » Documentation

Doxygen Source Code Documentation


Main Page   Alphabetical List   Data Structures   File List   Data Fields   Globals   Search  

AFNI Source Code Data Structure Index

  _  
EMSspec   jpeg_marker_reader   node   SUMA_KUBATEST_OPTIONS   
_BitBucket   Entrypoint   jpeg_marker_struct   node_list_t   SUMA_LinkedPtr   
_CursorTable   ENV_var   jpeg_marker_writer   NOTE_wind   SUMA_LIST_WIDGET   
_dnode   Equivblock   jpeg_memory_mgr   NP_options   SUMA_M2M_STRUCT   
_gbuffer   Eqvchain   jpeg_progress_mgr   
  O  
SUMA_MEMBER_FACE_SETS   
_GLUTcolorcell   Errorblock   jpeg_scan_info   olist   SUMA_MEMTRACE_STRUCT   
_GLUTcolormap   Exprblock   jpeg_source_mgr   option   suma_menu_item   
_GLUTeventParser   Expression   jpeg_transform_info   optiondata   SUMA_MenuCallBackData   
_GLUTmenu   extract_data   jpeg_upsampler   options_t   SUMA_MessageData   
_GLUTmenuItem   extrema   JQUANT_TBL   opts_t   SUMA_MorphInfo   
_GLUToverlay   Extsym   jvirt_barray_control   OtherData   SUMA_MT_INTERSECT_TRIANGLE   
_GLUTstale   
  F  
jvirt_sarray_control   OtherElem   SUMA_NEW_SO_OPT   
_GLUTtimer   Face   
  K  
  P  
SUMA_NIML_DRAWN_ROI   
_GLUTwindow   facetT   Keylist   param_t   SUMA_NIML_ROI_DATUM   
_key   fbuf_alloc_t   KILL_list   Paramblock   SUMA_NODE_FIRST_NEIGHB   
_LiteClueClassRec   fbuf_t   kpart   PARSER_code   SUMA_NODE_NEIGHB_LAYER   
_LiteClueRec   FD_brick   
  L  
parser_t   SUMA_OFFSET_LL_DATUM   
_node   fftw_codelet_desc   Labelblock   PBAR_palette   SUMA_OFFSET_STRUCT   
_OverlayInfo   fftw_complex   large_pool_struct   PBAR_palette_array   SUMA_OLD_BRUSH_STROKE   
_Range   fftw_plan_node_struct   LDP_list   PBAR_palette_table   SUMA_OPEN_DX_STRUCT   
_Slot   fftw_plan_struct   ldp_surf_list   PCOR_references   SUMA_OVERLAY_LIST_DATUM   
_snode   fftw_rader_data_struct   line_opt   PCOR_voxel_corr   SUMA_OVERLAY_PLANE_DATA   
_undo_buf   fftw_twiddle_struct   List_   pdf   SUMA_OVERLAYS   
_vp_context   fftwnd_data   list_thread_str   pgm_instance_t   SUMA_PARSED_NAME   
_XLayerVisualInfo   FilterTemplate   Listblock   phuff_entropy_decoder   SUMA_PATCH   
  A  
FIM_menu   ListElmt_   phuff_entropy_encoder   SUMA_PROMPT_DIALOG_STRUCT   
adaptive_slot   FIM_options   liteClue_context_str   picture_t   SUMA_QSORTROW_FLOAT   
Addrblock   FIMdata   LiteClueClassPart   pixel   SUMA_QSORTROW_INT   
adwarp_options   finfo_t   LiteCluePart   PLUGIN_impopper   SUMA_rb_group   
AF_options   fixed_param   Literal   PlyElement   SUMA_RGB_NAME   
AFNI_datamode_widgets   FIXED_plugin   LONG_WORD   PlyFile   SUMA_ROI   
AFNI_driver_pair   flex   lst_head   PlyOtherElems   SUMA_ROI_ACTION_STRUCT   
AFNI_fimmer_type   float_list   lst_node   PlyOtherProp   SUMA_ROI_DATUM   
AFNI_friend   float_list_t   
  M  
PlyProperty   SUMA_ROI_PLANE   
AFNI_function_widgets   floatp_list   mallitem   Point2Struct   SUMA_SAVESO_STRUCT   
AFNI_imaging_widgets   floatpair   mask_opt_s   Point3Struct   SUMA_SCALE_TO_MAP_OPT   
AFNI_library_type   floatvec   matrix   point_list_s   SUMA_SegmentDO   
AFNI_marks_widgets   floatvecvec   maxima_s   points_t   SUMA_SELECTION_DIALOG_STRUCT   
AFNI_ovtemplate   Fmtlist   MBAtab   port_list   SUMA_SFname   
AFNI_program_widgets   fourbytes   MBtab   Primblock   SUMA_SO_map   
AFNI_receiver   FrameTableStruct   MCW_3shear   PRIVATE_OBJECT   SUMA_SpecSurfInfo   
AFNI_Surface_Domain   fsl_def   MCW_action_item   PRV_ELEMENT_ITEM   SUMA_SphereMarker   
AFNI_surface_widgets   fspec   MCW_arrowpad   PRV_GROUP_ITEM   SUMA_STRING   
AFNI_view_info   func_t   MCW_arrowval   Punctlist   SUMA_SureFit_struct   
AFNI_viewing_widgets   fvector   MCW_bbox   pv2s_globals   SUMA_SURF_NORM   
AFNI_widget_set   fXYZ   MCW_choose_cbs   
  Q  
SUMA_SURF_PLANE_INTERSECT   
AGNI_nod   
  G  
MCW_choose_data   Qadgop_byte   SUMA_surface   
AIVVVV_imseq   ge4_header   MCW_cluster   Qadgop_complex   SUMA_SURFACE_CURVATURE   
AJ_rgb_str   ge4_image_t   MCW_cluster_array   Qadgop_double   SUMA_surfacegroup   
alist   ge4_series_t   MCW_DC   Qadgop_float   SUMA_SurfaceObject   
anova_options   ge4_study_t   MCW_DCOV   Qadgop_int   SUMA_SurfaceViewer   
AP_define   ge_extras   MCW_function_list   Qadgop_pointer   SUMA_SURFCLUST_OPTIONS   
AREN_stuff   ge_header_info   MCW_graf   Qadgop_rgb   SUMA_SurfSpecFile   
arg_info   ge_off   MCW_grapher   Qadgop_rgba   SUMA_TABLE_FIELD   
Argtypes   GENERIC   MCW_grapher_status   Qadgop_short   SUMA_TRI_BRANCH   
ART_comm   getret   MCW_idcode   qhmemT   SUMA_ViewState   
ATR_any   Gif_Color   MCW_imseq   qhstatT   SUMA_ViewState_Hist   
ATR_float   GIF_Color   MCW_imseq_status   qhT   SUMA_vnlist   
ATR_int   Gif_Colormap   MCW_imsize   
  R  
SUMA_VolDiffDataStruct   
ATR_string   Gif_Comment   MCW_interruptables   r_afni_s   SUMA_VOLPAR   
ATTR_ALIGN   Gif_Context   MCW_pasgraf   r_alg_s   SUMA_VTI   
Atype   Gif_DeletionHook   MCW_pbar   r_ipt_t   SUMA_vvlist   
  B  
Gif_Extension   MCW_textwin   r_pt_conn_s   SUMA_X   
backing_store_struct   Gif_Histogram   MD5_CTX   r_X_s   SUMA_X_AllView   
basin   Gif_Image   mday   RA_options   SUMA_X_DrawROI   
basis_expansion   GIF_Image_Hdr   mem   range_3dmm   SUMA_X_SumaCont   
basis_func   Gif_Node   MEM_3dline   range_3dmm_res   SUMA_X_SurfCont   
basis_irc   Gif_OptData   MEM_3dobject   RCREND_cutout   SUMA_X_ViewCont   
BFIT_data   Gif_Reader   MEM_3dplotdata   references   SUMA_Z_QSORT_DOUBLE   
BFIT_result   Gif_Record   MEM_3dtriangle   registry_entry   SUMA_Z_QSORT_FLOAT   
bitBucket   GIF_Screen_Hdr   MEM_plotdata   REND_cutout   SUMA_Z_QSORT_INT   
BitmapCharRec   Gif_Stream   MEM_topshell_data   RENDER_state   surf_t   
BitmapFontRec   GIF_Table   memblock   RENDER_state_array   syl   
bitread_perm_state   Gif_Writer   mergeT   rgb   SYM_irange   
bitread_working_state   Gif_XColormap   methods_struct   rgba   
  T  
bitvec   Gif_XContext   mga_vid_config_t   RGBIntPixel   table_entry   
box   glob_t   mincdim   rgbvox   tcdfvar   
bs_def   Global   MinMaxOctree   rgbyte   THD_3dim_dataset   
btree   GRA_cbs   MMOctreeLevel   ridgeT   THD_3dim_dataset_array   
bucket   GRA_miscellaneous   model   riu   THD_affine_warp   
bvarr   graf_state   MODEL_interface   RLEVoxelHdr   THD_brick_stats   
  C  
Graph_xy   MotifWmHints   RLEVoxels   THD_coorder   
c_derived_tbl   GrayIntPixel   motion_t   ROI   THD_datablock   
CBPtab   GROUP_DESCRIPTION   motparm   ROI_seg   THD_datablock_array   
cdjpeg_progress_mgr   GROUPPTR   mpeg2_info_t   Rplblock   THD_dataxes   
Chain   Gt_ColorChange   mpeg2_mc_t   RT_input   THD_dfvec3   
cilist   Gt_ColorTransform   mpeg2dec_s   run_t   THD_diskptr   
cjpeg_source_struct   Gt_Crop   mpegFrame   RunData   THD_dmat33   
ClassInfo   Gt_Frame   MREN_stuff   
  S  
THD_dvec3   
clipvec   Gt_Frameset   MRI_2dalign_basis   s2v_opts_t   THD_dvecmat   
CLIST   Gt_OutputData   MRI_3dalign_basis   S_16_c   THD_fvec3   
CList_   Gt_Viewer   mri_cohar   SAM_HDR   THD_ivec3   
CListElmt_   
  H  
MRI_DATA   savable_state   THD_linear_mapping   
cllist   hashentry   MRI_IMAGE   ScanOffset   THD_marker_set   
Clp_ArgType   Hashentry   MRI_IMARR   SEQ   THD_mat33   
Clp_BuildString   hashtab   MRI_warp3D_align_basis   sequence_t   THD_session   
Clp_Internal   Headblock   MRI_warp3D_param_def   SER_vector   THD_sessionlist   
Clp_LongMinMatch   header_key   multiplier_table   setelemT   THD_slist_find   
Clp_Option   header_stuff   Multitype   setT   THD_statistics   
Clp_Parser   HeadModel_Info   multivector   SF_interval   THD_string_array   
Clp_ParserState   hemi_s   MVtab   SHMioc   THD_talairach_12_warp   
Clp_StringList   hilbert_data_V2   my_coef_controller   short3   THD_timeaxis   
cluster   holes_s   my_color_converter   short_list   THD_udv33   
color_hash_item   Htable   my_color_deconverter   SHORT_WORD   THD_usertag   
colorhist_item   HUBER_interface   my_comp_master   shortp_list   THD_usertaglist   
colorhist_list_item   huff_entropy_decoder   my_cquantizer   shortvox   THD_vecmat   
comment_buf   huff_entropy_encoder   my_decomp_master   Siemens_extra_info   THD_warp   
COMPLEX   
  I  
my_destination_mgr   Siemens_vision_header   Three_D_View   
complex   icilist   my_downsampler   small_pool_struct   thresh_result   
Constant   ieee_double   my_error_mgr   spanfit   time_series   
Constblock   ieee_single_hi   my_fdct_controller   Specblock   time_series_array   
ConstructionBuffer   ieee_single_lo   my_idct_controller   srfblk_1_   Tmask   
convert_init_s   IFM_debug   my_input_controller   srfip1_1_   to3d_data   
convert_rgb_t   im_store_t   my_main_controller   StackElem   to3d_widget_set   
CoordRec   image_dimension   my_marker_reader   stats_t   Transparency   
covmat   Image_Info   my_marker_writer   STREE   Trapezoid   
cpu_state_t   Impldoblock   my_memory_mgr   string_list   ttatlas_compendium   
CR_bigstuff   Inclfile   my_post_controller   StrokeCharRec   TTO_point   
CR_data   inlist   my_prep_controller   StrokeFontRec   TTRR_controls   
CR_debug   input_options   my_source_mgr   StrokeRec   TTRR_params   
CR_xhairs   InputFileEntryStruct   my_upsampler   SUMA_1D_DRAWN_ROI   twobytes   
CREN_stuff   int_array   mytimeout   SUMA_1dData   
  U  
Ctlframe   int_list   
  N  
SUMA_ACTION_STACK_DATA   ufloat   
CUTOUT_state   int_pair   Nameblock   SUMA_AFNI_COLORS   UID_BLOCK   
  D  
int_triple   Namelist   SUMA_AfniCom   UID_DESCRIPTION   
d_derived_tbl   intermap   NC   SUMA_AreaDiffDataStruct   Uint   
data_history   interp_s   NC_attr   SUMA_ARROW_TEXT_FIELD   UN_options   
DC_colordef   intp_list   NC_attrarray   SUMA_ASSEMBLE_LIST_STRUCT   unit   
DC_options   intpair   NC_dim   SUMA_Axis   UTL_FILEITEM   
DCM_ELEMENT   Intrbits   NC_dimarray   SUMA_AxisSegmentInfo   UTL_TIMESTRUCTURE   
DCM_ELEMENT_NODE   Intrblock   NC_string   SUMA_BRANCH   
  V  
DCM_FILE_META   intrealT   NC_var   SUMA_BRUSH_STROKE_DATUM   v1hs   
DCM_FLAGGED_ELEMENT   Intrpacked   NC_vararray   SUMA_CLIENT_DATA   v2s_oob_t   
DCM_FRAGMENT_ITEM   intvec   ncatt   SUMA_CLUST_DATUM   v2s_opts_t   
DCM_SEQUENCE_ITEM   io_setup   ncdim   SUMA_CMAP_RENDER_AREA   v2s_param_t   
DCM_TAG_NODE   iob_data   ncio   SUMA_COLOR_MAP   v2s_plugin_opts   
DCMDICT   IOCHAN   ncio_ffio   SUMA_COLOR_SCALED_VECT   v2s_results   
dcomplex   Ioclist   ncio_px   SUMA_COLORLIST_STRUCT   Vardesc   
dct_data_tye_struct   IR_options   ncio_spx   SUMA_COMM_STRUCT   vector   
DCtab   ISQ_bdef   ncvar   SUMA_CommonFields   Version_2_Header   
DCTtab   ISQ_boxdef   NI_affine_3dmap   SUMA_CONTOUR_EDGES   Vertex   
decoder_s   ISQ_cbs   NI_byte_vector   SUMA_CREATE_TEXT_SHELL_STRUCT   vertexT   
defines   ISQ_glob_statistics   NI_complex_vector   SUMA_CrossHair   vnode   
DELAY_options   ISQ_indiv_statistics   NI_converterstruct   SUMA_DIJKSTRA_PATH_CHAIN   vo_driver_t   
detail_def   ISQ_options   NI_dataset   SUMA_DO   vo_instance_s   
detalmv_def   
  J  
NI_double_vector   SUMA_DRAWN_ROI   vo_setup_result_t   
Dimblock   JHUFF_TBL   NI_element   SUMA_DSET   void_list   
DIME_message   jpeg_c_coef_controller   NI_float_one   SUMA_DVEC   voidp_list   
DIME_part   jpeg_c_main_controller   NI_float_vector   SUMA_EDGE_LIST   vol_t   
dimen   jpeg_c_prep_controller   NI_group   SUMA_EngineData   voxel   
dimon_stuff_t   jpeg_color_converter   NI_int_vector   SUMA_FACESET_FIRST_EDGE_NEIGHB   voxel_corr   
Dims   jpeg_color_deconverter   NI_mallitem   SUMA_FaceSetMarker   VRMAP   
djpeg_dest_struct   jpeg_color_quantizer   NI_objcontainer   SUMA_FileName   
  W  
dL   jpeg_common_struct   NI_points_domain   SUMA_FORM_AFNI_DSET_STRUCT   WA_options   
DList_   jpeg_comp_master   NI_procins   SUMA_FreeSurfer_struct   warp3D_basis   
DListElmt_   jpeg_component_info   NI_rect_domain   SUMA_FS_COLORTABLE   warp3D_box   
dlopen_handle   jpeg_compress_struct   NI_rgb_vector   SUMA_FS_COLORTABLE_ENTRY   warp3D_transform   
DMVtab   jpeg_d_coef_controller   NI_rgba_vector   SUMA_FVEC   working_state   
dobuf   jpeg_d_main_controller   NI_rowtype   SUMA_GENERIC_ARGV_PARSE   
  X  
Dotlist   jpeg_d_post_controller   NI_short_vector   SUMA_GENERIC_PROG_OPTIONS_STRUCT   X11_colordef   
doublecomplex   jpeg_decomp_master   NI_statistic   SUMA_GEOMVIEW_STRUCT   XMScontext   
dset_range   jpeg_decompress_struct   NI_str_array   SUMA_GET_OFFSET_STRUCT   XMSPTR   
dsr   jpeg_destination_mgr   NI_stream_type   SUMA_ijk   XMSspec   
Dtable   jpeg_downsampler   NI_string_vector   SUMA_INODE   XtPointer_array   
DTREE   jpeg_entropy_decoder   NI_struct   SUMA_IRGB   
  Y  
  E  
jpeg_entropy_encoder   NI_vector   SUMA_irgba   YuvLine   
EDB   jpeg_error_mgr   niftiwr_opts_t   SUMA_ISINBOX   YYSTYPE   
EDIT_options   jpeg_forward_dct   NL_options   SUMA_ISINSPHERE   
  Z  
eightbytes   jpeg_input_controller   NLFIT_MODEL   SUMA_IVEC   zzzz   
EMScontext   jpeg_inverse_dct   NLFIT_MODEL_array   SUMA_ixyz   
 

Powered by Plone

This site conforms to the following standards: