Hello,
I've received an error when attempting to run a 3x2 ANOVA through 3dMVM. I have never seen this error before, it seems to be R-related. Any ideas on solutions or better ways of structuring the ANOVA. The file was run with more than enough memory. My runfile code is below, and in the actual .txt file the columns are separated appropriately.
Thank you,
Mikey
3dMVM -prefix ST_ANOVA_aVf_HCvPCvIED -jobs 64 \
-bsVars 'condition*age+sex' \
-wsVars 'contrasts'\
-qVars 'age,motion' \
-qVarCenters '31.557,0.07949' \
-num_glf 1 \
-glfLabel 1 ST_ANOVA_aVf_HCvPCvIED -glfCode 1 'contrasts : 1*angry -1*fear condition : 1*HC -1*IED & 1*HC -1*PC & 1*IED -1*PC'\
-dataTable \
Subj condition age sex motion contrasts InputFile \
1 HC 45 1 0.08807 angry stats.001_REML+tlrc.'[20]'\
6 HC 26 2 0.0640 angry stats.006_REML+tlrc.'[20]'\
8 HC 33 1 0.0884 angry stats.008_REML+tlrc.'[20]'\
9 HC 49 1 0.0657 angry stats.009_REML+tlrc.'[20]'\
10 HC 25 2 0.0337 angry stats.010_REML+tlrc.'[20]'\
20 HC 33 2 0.0532 angry stats.020_REML+tlrc.'[20]'\
21 HC 37 2 0.0663 angry stats.021_REML+tlrc.'[20]'\
23 HC 49 2 0.0768 angry stats.023_REML+tlrc.'[20]'\
27 HC 31 2 0.0569 angry stats.027_REML+tlrc.'[20]'\
31 HC 27 2 0.0548 angry stats.031_REML+tlrc.'[20]'\
36 HC 23 2 0.0716 angry stats.036_REML+tlrc.'[20]'\
45 HC 46 2 0.0990 angry stats.045_REML+tlrc.'[20]'\
47 HC 23 2 0.0420 angry stats.047_REML+tlrc.'[20]'\
50 HC 21 1 0.1000 angry stats.050_REML+tlrc.'[20]'\
52 HC 22 1 0.0453 angry stats.052_REML+tlrc.'[20]'\
55 HC 54 2 0.1110 angry stats.055_REML+tlrc.'[20]'\
57 HC 23 1 0.0318 angry stats.057_REML+tlrc.'[20]'\
58 HC 24 2 0.0534 angry stats.058_REML+tlrc.'[20]'\
60 HC 21 2 0.0289 angry stats.060_REML+tlrc.'[20]'\
61 HC 48 1 0.0438 angry stats.061_REML+tlrc.'[20]'\
64 HC 26 2 0.1040 angry stats.064_REML+tlrc.'[20]'\
66 HC 29 1 0.0300 angry stats.066_REML+tlrc.'[20]'\
70 HC 22 1 0.0564 angry stats.070_REML+tlrc.'[20]'\
71 HC 27 2 0.0381 angry stats.071_REML+tlrc.'[20]'\
78 HC 21 2 0.0396 angry stats.078_REML+tlrc.'[20]'\
14 IED 39 1 0.0323 angry stats.014_REML+tlrc.'[20]'\
16 IED 21 1 0.047 angry stats.016_REML+tlrc.'[20]'\
17 IED 51 1 0.0546 angry stats.017_REML+tlrc.'[20]'\
19 IED 44 1 0.0776 angry stats.019_REML+tlrc.'[20]'\
29 IED 25 1 0.0555 angry stats.029_REML+tlrc.'[20]'\
34 IED 53 2 0.043 angry stats.034_REML+tlrc.'[20]'\
39 IED 26 1 0.0676 angry stats.039_REML+tlrc.'[20]'\
40 IED 27 1 0.0659 angry stats.040_REML+tlrc.'[20]'\
41 IED 32 1 0.046 angry stats.041_REML+tlrc.'[20]'\
46 IED 37 2 0.0409 angry stats.046_REML+tlrc.'[20]'\
56 IED 47 1 0.0498 angry stats.056_REML+tlrc.'[20]'\
67 IED 48 1 0.0554 angry stats.067_REML+tlrc.'[20]'\
79 IED 28 2 0.0325 angry stats.079_REML+tlrc.'[20]'\
80 IED 28 2 0.0415 angry stats.080_REML+tlrc.'[20]'\
81 IED 37 2 0.0826 angry stats.081_REML+tlrc.'[20]'\
83 IED 33 2 0.125 angry stats.083_REML+tlrc.'[20]'\
84 IED 25 2 0.0634 angry stats.084_REML+tlrc.'[20]'\
87 IED 38 1 0.087 angry stats.087_REML+tlrc.'[20]'\
88 IED 31 1 0.06 angry stats.088_REML+tlrc.'[20]'\
90 IED 31 1 0.0563 angry stats.090_REML+tlrc.'[20]'\
91 IED 26 1 0.101 angry stats.091_REML+tlrc.'[20]'\
4 PC 21 2 0.0341 angry stats.004_REML+tlrc.'[20]'\
7 PC 28 1 0.045 angry stats.007_REML+tlrc.'[20]'\
11 PC 25 1 0.0269 angry stats.011_REML+tlrc.'[20]'\
12 PC 36 1 0.154 angry stats.012_REML+tlrc.'[20]'\
13 PC 22 1 0.029 angry stats.013_REML+tlrc.'[20]'\
15 PC 43 1 0.0368 angry stats.015_REML+tlrc.'[20]'\
18 PC 48 1 0.0305 angry stats.018_REML+tlrc.'[20]'\
22 PC 23 1 0.044 angry stats.022_REML+tlrc.'[20]'\
24 PC 23 2 0.045 angry stats.024_REML+tlrc.'[20]'\
25 PC 24 2 0.0359 angry stats.025_REML+tlrc.'[20]'\
26 PC 28 2 0.0505 angry stats.026_REML+tlrc.'[20]'\
28 PC 27 2 0.042 angry stats.028_REML+tlrc.'[20]'\
30 PC 24 1 0.0369 angry stats.030_REML+tlrc.'[20]'\
33 PC 22 1 0.0524 angry stats.033_REML+tlrc.'[20]'\
35 PC 25 2 0.0793 angry stats.035_REML+tlrc.'[20]'\
38 PC 21 2 0.108 angry stats.038_REML+tlrc.'[20]'\
43 PC 30 1 0.0449 angry stats.043_REML+tlrc.'[20]'\
48 PC 33 2 0.0335 angry stats.048_REML+tlrc.'[20]'\
51 PC 23 2 0.0365 angry stats.051_REML+tlrc.'[20]'\
53 PC 30 1 0.0502 angry stats.053_REML+tlrc.'[20]'\
59 PC 22 2 0.1047 angry stats.059_REML+tlrc.'[20]'\
63 PC 28 2 0.0545 angry stats.063_REML+tlrc.'[20]'\
72 PC 40 2 0.0339 angry stats.072_REML+tlrc.'[20]'\
74 PC 23 1 0.0398 angry stats.074_REML+tlrc.'[20]'\
75 PC 43 1 0.0433 angry stats.075_REML+tlrc.'[20]'\
86 PC 35 1 0.0784 angry stats.086_REML+tlrc.'[20]'\
1 HC 45 1 0.08807 fear stats.001_REML+tlrc.'[23]'\
6 HC 26 2 0.0640 fear stats.006_REML+tlrc.'[23]'\
8 HC 33 1 0.0884 fear stats.008_REML+tlrc.'[23]'\
9 HC 49 1 0.0657 fear stats.009_REML+tlrc.'[23]'\
10 HC 25 2 0.0337 fear stats.010_REML+tlrc.'[23]'\
20 HC 33 2 0.0532 fear stats.020_REML+tlrc.'[23]'\
21 HC 37 2 0.0663 fear stats.021_REML+tlrc.'[23]'\
23 HC 49 2 0.0768 fear stats.023_REML+tlrc.'[23]'\
27 HC 31 2 0.0569 fear stats.027_REML+tlrc.'[23]'\
31 HC 27 2 0.0548 fear stats.031_REML+tlrc.'[23]'\
36 HC 23 2 0.0716 fear stats.036_REML+tlrc.'[23]'\
45 HC 46 2 0.0990 fear stats.045_REML+tlrc.'[23]'\
47 HC 23 2 0.0420 fear stats.047_REML+tlrc.'[23]'\
50 HC 21 1 0.1000 fear stats.050_REML+tlrc.'[23]'\
52 HC 22 1 0.0453 fear stats.052_REML+tlrc.'[23]'\
55 HC 54 2 0.1110 fear stats.055_REML+tlrc.'[23]'\
57 HC 23 1 0.0318 fear stats.057_REML+tlrc.'[23]'\
58 HC 24 2 0.0534 fear stats.058_REML+tlrc.'[23]'\
60 HC 21 2 0.0289 fear stats.060_REML+tlrc.'[23]'\
61 HC 48 1 0.0438 fear stats.061_REML+tlrc.'[23]'\
64 HC 26 2 0.1040 fear stats.064_REML+tlrc.'[23]'\
66 HC 29 1 0.0300 fear stats.066_REML+tlrc.'[23]'\
70 HC 22 1 0.0564 fear stats.070_REML+tlrc.'[23]'\
71 HC 27 2 0.0381 fear stats.071_REML+tlrc.'[23]'\
78 HC 21 2 0.0396 fear stats.078_REML+tlrc.'[23]'\
14 IED 39 1 0.0323 fear stats.014_REML+tlrc.'[23]'\
16 IED 21 1 0.047 fear stats.016_REML+tlrc.'[23]'\
17 IED 51 1 0.0546 fear stats.017_REML+tlrc.'[23]'\
19 IED 44 1 0.0776 fear stats.019_REML+tlrc.'[23]'\
29 IED 25 1 0.0555 fear stats.029_REML+tlrc.'[23]'\
34 IED 53 2 0.043 fear stats.034_REML+tlrc.'[23]'\
39 IED 26 1 0.0676 fear stats.039_REML+tlrc.'[23]'\
40 IED 27 1 0.0659 fear stats.040_REML+tlrc.'[23]'\
41 IED 32 1 0.046 fear stats.041_REML+tlrc.'[23]'\
46 IED 37 2 0.0409 fear stats.046_REML+tlrc.'[23]'\
56 IED 47 1 0.0498 fear stats.056_REML+tlrc.'[23]'\
67 IED 48 1 0.0554 fear stats.067_REML+tlrc.'[23]'\
79 IED 28 2 0.0325 fear stats.079_REML+tlrc.'[23]'\
80 IED 28 2 0.0415 fear stats.080_REML+tlrc.'[23]'\
81 IED 37 2 0.0826 fear stats.081_REML+tlrc.'[23]'\
83 IED 33 2 0.125 fear stats.083_REML+tlrc.'[23]'\
84 IED 25 2 0.0634 fear stats.084_REML+tlrc.'[23]'\
87 IED 38 1 0.087 fear stats.087_REML+tlrc.'[23]'\
88 IED 31 1 0.06 fear stats.088_REML+tlrc.'[23]'\
90 IED 31 1 0.0563 fear stats.090_REML+tlrc.'[23]'\
91 IED 26 1 0.101 fear stats.091_REML+tlrc.'[23]'\
4 PC 21 2 0.0341 fear stats.004_REML+tlrc.'[23]'\
7 PC 28 1 0.045 fear stats.007_REML+tlrc.'[23]'\
11 PC 25 1 0.0269 fear stats.011_REML+tlrc.'[23]'\
12 PC 36 1 0.154 fear stats.012_REML+tlrc.'[23]'\
13 PC 22 1 0.029 fear stats.013_REML+tlrc.'[23]'\
15 PC 43 1 0.0368 fear stats.015_REML+tlrc.'[23]'\
18 PC 48 1 0.0305 fear stats.018_REML+tlrc.'[23]'\
22 PC 23 1 0.044 fear stats.022_REML+tlrc.'[23]'\
24 PC 23 2 0.045 fear stats.024_REML+tlrc.'[23]'\
25 PC 24 2 0.0359 fear stats.025_REML+tlrc.'[23]'\
26 PC 28 2 0.0505 fear stats.026_REML+tlrc.'[23]'\
28 PC 27 2 0.042 fear stats.028_REML+tlrc.'[23]'\
30 PC 24 1 0.0369 fear stats.030_REML+tlrc.'[23]'\
33 PC 22 1 0.0524 fear stats.033_REML+tlrc.'[23]'\
35 PC 25 2 0.0793 fear stats.035_REML+tlrc.'[23]'\
38 PC 21 2 0.108 fear stats.038_REML+tlrc.'[23]'\
43 PC 30 1 0.0449 fear stats.043_REML+tlrc.'[23]'\
48 PC 33 2 0.0335 fear stats.048_REML+tlrc.'[23]'\
51 PC 23 2 0.0365 fear stats.051_REML+tlrc.'[23]'\
53 PC 30 1 0.0502 fear stats.053_REML+tlrc.'[23]'\
59 PC 22 2 0.1047 fear stats.059_REML+tlrc.'[23]'\
63 PC 28 2 0.0545 fear stats.063_REML+tlrc.'[23]'\
72 PC 40 2 0.0339 fear stats.072_REML+tlrc.'[23]'\
74 PC 23 1 0.0398 fear stats.074_REML+tlrc.'[23]'\
75 PC 43 1 0.0433 fear stats.075_REML+tlrc.'[23]'\
86 PC 35 1 0.0784 fear stats.086_REML+tlrc.'[23]'\
