rm -fr data_ap data_epi
rm -f log/*

rm -f ../RT_input/RT_extras/file_list_3_echoes.txt
if ( -f ../RT_input/RT_extras/vr_base_min_outlier+orig.HEAD ) then
   rm -f ../RT_input/RT_extras/vr_base_min_outlier+orig.*
endif
if ( -f ../RT_input/RT_extras/s5.t2.star+orig.HEAD ) then
   rm -f ../RT_input/RT_extras/s5.t2.star+orig.*
endif