AFNI program: 3dMean

Output of -help


Usage: 3dMean [options] dset dset ...
Takes the voxel-by-voxel mean of all input datasets;
the main reason is to be faster than 3dcalc.

Options [see 3dcalc -help for more details on these]:
  -verbose    = Print out some information along the way.
  -prefix ppp = Sets the prefix of the output dataset.
  -datum ddd  = Sets the datum of the output dataset.
  -fscale     = Force scaling of the output to the maximum integer range.
  -gscale     = Same as '-fscale', but also forces each output sub-brick to
                  to get the same scaling factor.
  -nscale     = Don't do any scaling on output to byte or short datasets.
                  ** Only use this option if you are sure you
                     want the output dataset to be integer-valued!
  -non_zero   = Use only non-zero values for calculation of mean or squares

  -sd *OR*    = Calculate the standard deviation, sqrt(variance), instead
  -stdev         of the mean (cannot be used with -sqr, -sum or -non_zero).

  -sqr        = Average the squares, instead of the values.
  -sum        = Just take the sum (don't divide by number of datasets).
  -count      = compute only the count of non-zero voxels.

  -mask_inter = Create a simple intersection mask.
  -mask_union = Create a simple union mask.

                The masks will be set by any non-zero voxels in
                the input datasets.

  -weightset WSET = Sum of N dsets will be weighted by N volume WSET.
                    e.g. -weightset opt_comb_weights+tlrc
                This weight dataset must be of type float.

N.B.: All input datasets must have the same number of voxels along
       each axis (x,y,z,t).
    * At least 2 input datasets are required.
    * Dataset sub-brick selectors [] are allowed.
    * The output dataset origin, time steps, etc., are taken from the
       first input dataset.
*** If you are trying to compute the mean (or some other statistic)
    across time for a 3D+time dataset (not across datasets), use
    3dTstat instead.

++ Compile date = Aug 15 2018 {AFNI_18.2.11:linux_openmp_64}


This page auto-generated on Wed Aug 15 18:17:14 EDT 2018