AFNI program: 3dTSgen

Output of -help


++ 3dTSgen: AFNI version=AFNI_18.3.03 (Oct 19 2018) [64-bit]
++ Authored by: B. Douglas Ward
This program generates an AFNI 3d+time data set.  The time series for 
each voxel is generated according to a user specified signal + noise  
model.                                                              

Usage:                                                                
3dTSgen                                                               
-input fname       fname = filename of prototype 3d + time data file  
[-inTR]            set the TR of the created timeseries to be the TR  
                     of the prototype dataset                         
                     [The default is to compute with TR = 1.]         
                     [The model functions are called for a  ]         
                     [time grid of 0, TR, 2*TR, 3*TR, ....  ]         
-signal slabel     slabel = name of (non-linear) signal model         
-noise  nlabel     nlabel = name of (linear) noise model              
-sconstr k c d     constraints for kth signal parameter:              
                      c <= gs[k] <= d                                 
-nconstr k c d     constraints for kth noise parameter:               
                      c+b[k] <= gn[k] <= d+b[k]                       
-sigma  s          s = std. dev. of additive Gaussian noise           
[-voxel num]       screen output for voxel #num                       
-output fname      fname = filename of output 3d + time data file     
                                                                      
                                                                      
The following commands generate individual AFNI 1 sub-brick datasets: 
                                                                      
[-scoef k fname]   write kth signal parameter gs[k];                  
                     output 'fim' is written to prefix filename fname 
[-ncoef k fname]   write kth noise parameter gn[k];                   
                     output 'fim' is written to prefix filename fname 
                                                                      
                                                                      
The following commands generate one AFNI 'bucket' type dataset:       
                                                                      
[-bucket n prefixname]   create one AFNI 'bucket' dataset containing  
                           n sub-bricks; n=0 creates default output;  
                           output 'bucket' is written to prefixname   
The mth sub-brick will contain:                                       
[-brick m scoef k label]   kth signal parameter regression coefficient
[-brick m ncoef k label]   kth noise parameter regression coefficient 

++ Compile date = Oct 19 2018 {AFNI_18.3.03:linux_openmp_64}


This page auto-generated on Fri Oct 19 17:21:53 EDT 2018