AFNI program: @afni_refacer_make_master_addendum

Output of -help



++ work on pre-shell

++ 3dcalc: AFNI version=AFNI_20.3.01 (Oct 19 2020) [64-bit]
++ Authored by: A cast of thousands
** FATAL ERROR: can't open dataset afni_refacer_shell.nii.gz
** Program compile date = Oct 19 2020
++ no -frac option: defaulting to -union
++ processing 1 input dataset(s), NN=2...
++ padding all datasets by 2 (for dilations)
** FATAL ERROR: failed to open mask dataset '__preshell_00_min1.nii'
** Program compile date = Oct 19 2020
** FATAL ERROR: Can't open dataset 'afni_refacer_shell.nii.gz'
** Program compile date = Oct 19 2020
++ 3dcalc: AFNI version=AFNI_20.3.01 (Oct 19 2020) [64-bit]
++ Authored by: A cast of thousands
** FATAL ERROR: can't open dataset __preshell_00_min1.nii
** Program compile date = Oct 19 2020

++ start work on main shell

++ processing __preshell_02_extra_shell.nii ...
** FATAL ERROR: Can't open dataset '__preshell_02_extra_shell.nii'
** Program compile date = Oct 19 2020
++ 3dZeropad: AFNI version=AFNI_20.3.01 (Oct 19 2020) [64-bit]
** 3dZeropad: Can't open -master afni_refacer_shell.nii.gz
++ no -frac option: defaulting to -union
++ processing 1 input dataset(s), NN=2...
++ padding all datasets by 0 (for dilations)
** FATAL ERROR: failed to open mask dataset '__refacer_01_grid.nii'
** Program compile date = Oct 19 2020
++ 3dcalc: AFNI version=AFNI_20.3.01 (Oct 19 2020) [64-bit]
++ Authored by: A cast of thousands
** FATAL ERROR: can't open dataset __shell_00_LR.nii
** Program compile date = Oct 19 2020
** FATAL ERROR: Can't open time series dataset '__shell_02_sym.nii'.
** Program compile date = Oct 19 2020
++ 3dcalc: AFNI version=AFNI_20.3.01 (Oct 19 2020) [64-bit]
++ Authored by: A cast of thousands
** FATAL ERROR: can't open dataset __shell_02c_sym_dat.nii
** Program compile date = Oct 19 2020
++ no -frac option: defaulting to -union
++ processing 1 input dataset(s), NN=2...
++ padding all datasets by 6 (for dilations)
** FATAL ERROR: failed to open mask dataset '__shell_03_sym_thr.nii'
** Program compile date = Oct 19 2020
++ 3dcalc: AFNI version=AFNI_20.3.01 (Oct 19 2020) [64-bit]
++ Authored by: A cast of thousands
** FATAL ERROR: can't open dataset __shell_04_sym_thr_dil.nii
** Program compile date = Oct 19 2020
++ 3dBlurInMask: AFNI version=AFNI_20.3.01 (Oct 19 2020) [64-bit]
++ Authored by: RW Cox
** FATAL ERROR: Can't open dataset '__shell_02c_sym_dat.nii'
** Program compile date = Oct 19 2020
** FATAL ERROR: Can't open time series dataset '__shell_06_blurinmask.nii'.
** Program compile date = Oct 19 2020
++ 3dcalc: AFNI version=AFNI_20.3.01 (Oct 19 2020) [64-bit]
++ Authored by: A cast of thousands
** FATAL ERROR: can't open dataset __shell_06_blurinmask.nii
** Program compile date = Oct 19 2020

++ work on defacing part

++ 3dcalc: AFNI version=AFNI_20.3.01 (Oct 19 2020) [64-bit]
++ Authored by: A cast of thousands
** FATAL ERROR: can't open dataset afni_refacer_shell_sym_1.0.nii.gz
** Program compile date = Oct 19 2020
++ 3dcalc: AFNI version=AFNI_20.3.01 (Oct 19 2020) [64-bit]
++ Authored by: A cast of thousands
** FATAL ERROR: can't open dataset __deface_00_bool.nii
** Program compile date = Oct 19 2020

++ combine re- and de-facers, and finalize

++ 3dTcat: AFNI version=AFNI_20.3.01 (Oct 19 2020) [64-bit]
** FATAL ERROR: Can't open dataset afni_refacer_shell_sym_1.0.nii.gz
** Program compile date = Oct 19 2020
++ 3drefit: AFNI version=AFNI_20.3.01 (Oct 19 2020) [64-bit]
++ Authored by: RW Cox
** ERROR: Can't open dataset afni_refacer_shell_sym_1.0.nii.gz
++ 3drefit processed 0 datasets
++ 3drefit: AFNI version=AFNI_20.3.01 (Oct 19 2020) [64-bit]
++ Authored by: RW Cox
** ERROR: Can't open dataset afni_refacer_shell_sym_1.0.nii.gz
++ 3drefit processed 0 datasets


++ DONE:  afni_refacer_shell_sym_1.0.nii.gz



This page auto-generated on Mon Oct 19 20:24:06 EDT 2020