AFNI program: AnalyzeTrace

Output of -help


Usage: A program to analyze SUMA (and AFNI's perhaps) stack output
       The program can detect functions that return with RETURN without
       bothering to go on the stack.
   AnaylzeTrace [options] FILE 
       where FILE is obtained by redirecting program's trace output.
Optional Param:
   -max_func_lines N: Set the maximum number of code lines before a function
                      returns. Default is no limit.
   -suma_c: FILE is a SUMA_*.c file. It is analyzed for functions 
            that use SUMA_ RETURN 
            (typo on purpose to avoid being caught here) without ENTRY
       Note: The file for this program has special strings 
            (in comments at times)
            to avoid false alarms when processing it.
            
   -max_err MAX_ERR: Stop after encountering MAX_ERR errors
                     reported in log. Default is 5.
                     Error key terms are:
                     'Error', 'error', 'corruption'

   You should also search for the string: 'Note No RETURN or exit here'.
   Its occurrence can be an error at times.

   [-novolreg]: Ignore any Rotate, Volreg, Tagalign, 
                or WarpDrive transformations present in 
                the Surface Volume.
   [-noxform]: Same as -novolreg
   [-setenv "'ENVname=ENVvalue'"]: Set environment variable ENVname
                to be ENVvalue. Quotes are necessary.
             Example: suma -setenv "'SUMA_BackgroundColor = 1 0 1'"
                See also options -update_env, -environment, etc
                in the output of 'suma -help'
  Common Debugging Options:
   [-trace]: Turns on In/Out debug and Memory tracing.
             For speeding up the tracing log, I recommend 
             you redirect stdout to a file when using this option.
             For example, if you were running suma you would use:
             suma -spec lh.spec -sv ... > TraceFile
             This option replaces the old -iodbg and -memdbg.
   [-TRACE]: Turns on extreme tracing.
   [-nomall]: Turn off memory tracing.
   [-yesmall]: Turn on memory tracing (default).
  NOTE: For programs that output results to stdout
    (that is to your shell/screen), the debugging info
    might get mixed up with your results.


Global Options (available to all AFNI/SUMA programs)
  -h: Mini help, at time, same as -help in many cases.
  -help: The entire help output
  -HELP: Extreme help, same as -help in majority of cases.
  -h_view: Open help in text editor. AFNI will try to find a GUI editor
  -hview : on your machine. You can control which it should use by
           setting environment variable AFNI_GUI_EDITOR.
  -h_web: Open help in web browser. AFNI will try to find a browser.
  -hweb : on your machine. You can control which it should use by
          setting environment variable AFNI_GUI_EDITOR. 
  -h_find WORD: Look for lines in this programs's -help output that match
                (approximately) WORD.
  -h_raw: Help string unedited
  -h_spx: Help string in sphinx loveliness, but do not try to autoformat
  -h_aspx: Help string in sphinx with autoformatting of options, etc.
  -all_opts: Try to identify all options for the program from the
             output of its -help option. Some options might be missed
             and others misidentified. Use this output for hints only.
  


Compile Date:
   Apr 18 2024

       Ziad S. Saad SSCC/NIMH/NIH saadz@mail.nih.gov     
This page auto-generated on Thu Apr 18 14:46:14 EDT 2024