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# create masks
for each run using 3dAutomask
#===============================================================
foreach run (
`count -digits 1 1 10` )
3dAutomask -prefix
mask_r{$run} {$subj}_r{$run}_vr_bl+orig
end
#===============================================================
# create a mask
enveloping masks of the individual runs
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3dcalc -a
mask_r1+orig -b mask_r2+orig -c mask_r3+orig \
-d
mask_r4+orig -e mask_r5+orig -f mask_r6+orig \
-g
mask_r7+orig -h mask_r8+orig -i mask_r9+orig \
-j
mask_r10+orig
\
-expr
'step(a+b+c+d+e+f+g+h+i+j)'
\
-prefix
full_mask