Hi,
I am running AFNI version=AFNI_2007_03_06_0841 and am able to run 3dANOVA3 with the exception of an error message that appears for the command line -abmean i j prefix.
The error says 'Unrecognized command line option:
-abmean: Command not found.
Is this option no longer available for the version of AFNI that I am running? Below you'll see my anova script for clarity.
Thanks in advance for any help.
Aimee
******
3dANOVA3 -type 5 -alevels 2 -blevels 5 -clevels 12 \
-dset 1 1 1 AN_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 2 1 AN_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 3 1 AN_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 4 1 AN_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 5 1 AN_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 1 2 GD_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 2 2 GD_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 3 2 GD_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 4 2 GD_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 5 2 GD_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 1 3 WI_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 2 3 WI_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 3 3 WI_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 4 3 WI_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 5 3 WI_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 1 4 DR_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 2 4 DR_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 3 4 DR_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 4 4 DR_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 5 4 DR_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 1 5 KH_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 2 5 KH_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 3 5 KH_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 4 5 KH_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 5 5 KH_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 1 6 DF_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 2 6 DF_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 3 6 DF_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 4 6 DF_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 5 6 DF_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 1 7 FM_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 2 7 FM_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 3 7 FM_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 4 7 FM_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 5 7 FM_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 1 8 ET_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 2 8 ET_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 3 8 ET_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 4 8 ET_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 5 8 ET_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 1 9 FV_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 2 9 FV_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 3 9 FV_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 4 9 FV_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 5 9 FV_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 1 10 RJ_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 2 10 RJ_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 3 10 RJ_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 4 10 RJ_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 5 10 RJ_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 1 11 CG_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 2 11 CG_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 3 11 CG_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 4 11 CG_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 5 11 CG_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 1 12 JW_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 2 12 JW_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 3 12 JW_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 4 12 JW_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 1 5 12 JW_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 1 1 HB_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 2 1 HB_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 3 1 HB_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 4 1 HB_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 5 1 HB_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 1 2 JM_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 2 2 JM_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 3 2 JM_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 4 2 JM_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 5 2 JM_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 1 3 RM_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 2 3 RM_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 3 3 RM_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 4 3 RM_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 5 3 RM_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 1 4 SI_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 2 4 SI_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 3 4 SI_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 4 4 SI_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 5 4 SI_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 1 5 TL_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 2 5 TL_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 3 5 TL_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 4 5 TL_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 5 5 TL_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 1 6 IS_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 2 6 IS_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 3 6 IS_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 4 6 IS_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 5 6 IS_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 1 7 GN_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 2 7 GN_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 3 7 GN_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 4 7 GN_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 5 7 GN_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 1 8 SP_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 2 8 SP_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 3 8 SP_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 4 8 SP_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 5 8 SP_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 1 9 DC_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 2 9 DC_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 3 9 DC_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 4 9 DC_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 5 9 DC_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 1 10 SB_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 2 10 SB_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 3 10 SB_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 4 10 SB_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 5 10 SB_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 1 11 KJ_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 2 11 KJ_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 3 11 KJ_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 4 11 KJ_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 5 11 KJ_D5@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 1 12 JamW_D1@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 2 12 JamW_D2@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 3 12 JamW_D3@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 4 12 JamW_D4@1+tlrc'[0]' \
-dset 2 5 12 JamW_D5@1+tlrc'[0]' \
-voxel 1234567 \
-diskspace \
-fa group \
-fb digit \
-fab groupBYdigit \
-adiff 1 2 ControlvsFHD \
-amean 1 CON \
-amean 2 FHD \
-bmean 1 D1 \
-bmean 2 D2 \
-bmean 3 D3 \
-bmean 4 D4 \
-bmean 5 D5 \
-aBcontr 1 -1 : 1 CONvsFHD_D1 \
-aBcontr 1 -1 : 2 CONvsFHD_D2 \
-aBcontr 1 -1 : 3 CONvsFHD_D3 \
-aBcontr 1 -1 : 4 CONvsFHD_D4 \
-aBcontr 1 -1 : 5 CONvsFHD_D5 \
-aBdiff 1 2 : 1 diff_CONvsFHD_D1 \
-aBdiff 1 2 : 2 diff_CONvsFHD_D2 \
-aBdiff 1 2 : 3 diff_CONvsFHD_D3 \
-aBdiff 1 2 : 4 diff_CONvsFHD_D4 \
-aBdiff 1 2 : 5 diff_CONvsFHD_D5 \
-abmean 1 1 CON_D1 \
-abmean 1 2 CON_D2 \
-abmean 1 3 CON_D3 \
-abmean 1 4 CON_D4 \
-abmean 1 5 CON_D5 \
-abmean 2 1 FHD_D1 \
-abmean 2 2 FHD_D2 \
-abmean 2 3 FHD_D3 \
-abmean 2 4 FHD_D4 \
-abmean 2 5 FHD_D5 \
-bucket control_vs_FHD
