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AFNI Message Board

Dear AFNI users-

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Sincerely, AFNI HQ

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Peter Molfese

August 23, 2012 01:04PM

Registered: 11 years ago
Posts: 628

Hi Ziad-

Version info:
Version AFNI_2011_12_21_1014
[[Precompiled binary macosx_10.7_Intel_64: Aug 9 2012]]

This is data in the volume, not on the surface. Surface analyses are on the list of things to do later on though. I used the gen_group_command.py to generate the 3dMEMA script.

input to gen_group_command.py:

gen_group_command.py -command 3dMEMA \
-dsets stats*.HEAD \
-prefix aud_word_mismatch \
-subs_betas 28 \
-subs_tstats 29 \
-write_script aud_word_mismatch.tcsh \
-options -jobs 12 -mask newMask+tlrc -covariates cov_file.txt

Resulting file:

3dMEMA -prefix aud_word_mismatch                 \
       -set setA                                 \
          3257 "stats.sn3257_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3257_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          3460 "stats.sn3460_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3460_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          3516 "stats.sn3516_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3516_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          3585 "stats.sn3585_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3585_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          3603 "stats.sn3603_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3603_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          3610 "stats.sn3610_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3610_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          3612 "stats.sn3612_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3612_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          3626 "stats.sn3626_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3626_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          3677 "stats.sn3677_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3677_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          3682 "stats.sn3682_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3682_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          3698 "stats.sn3698_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3698_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          3782 "stats.sn3782_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3782_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          3785 "stats.sn3785_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3785_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          3786 "stats.sn3786_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3786_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          3806 "stats.sn3806_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3806_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          3845 "stats.sn3845_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn3845_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          4078 "stats.sn4078_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn4078_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          4416 "stats.sn4416_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn4416_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          4442 "stats.sn4442_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn4442_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          4668 "stats.sn4668_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn4668_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          4917 "stats.sn4917_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn4917_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          4979 "stats.sn4979_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn4979_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5107 "stats.sn5107_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5107_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5210 "stats.sn5210_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5210_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5211 "stats.sn5211_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5211_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5226 "stats.sn5226_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5226_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5347 "stats.sn5347_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5347_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5473 "stats.sn5473_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5473_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5637 "stats.sn5637_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5637_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5662 "stats.sn5662_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5662_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5692 "stats.sn5692_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5692_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5714 "stats.sn5714_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5714_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5730 "stats.sn5730_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5730_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5750 "stats.sn5750_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5750_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5772 "stats.sn5772_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5772_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5795 "stats.sn5795_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5795_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5838 "stats.sn5838_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5838_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5848 "stats.sn5848_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5848_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5906 "stats.sn5906_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5906_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          5974 "stats.sn5974_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn5974_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6048 "stats.sn6048_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6048_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6080 "stats.sn6080_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6080_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6187 "stats.sn6187_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6187_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6241 "stats.sn6241_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6241_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6242 "stats.sn6242_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6242_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6244 "stats.sn6244_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6244_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6259 "stats.sn6259_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6259_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6278 "stats.sn6278_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6278_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6303 "stats.sn6303_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6303_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6304 "stats.sn6304_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6304_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6316 "stats.sn6316_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6316_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6340 "stats.sn6340_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6340_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6383 "stats.sn6383_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6383_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6422 "stats.sn6422_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6422_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6488 "stats.sn6488_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6488_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6500 "stats.sn6500_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6500_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6694 "stats.sn6694_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6694_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6736 "stats.sn6736_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6736_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6875 "stats.sn6875_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6875_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6901 "stats.sn6901_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6901_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6912 "stats.sn6912_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6912_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6913 "stats.sn6913_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6913_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          6969 "stats.sn6969_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn6969_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7041 "stats.sn7041_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7041_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7174 "stats.sn7174_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7174_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7225 "stats.sn7225_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7225_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7319 "stats.sn7319_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7319_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7341 "stats.sn7341_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7341_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7372 "stats.sn7372_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7372_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7383 "stats.sn7383_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7383_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7404 "stats.sn7404_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7404_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7433 "stats.sn7433_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7433_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7436 "stats.sn7436_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7436_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7463 "stats.sn7463_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7463_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7495 "stats.sn7495_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7495_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7498 "stats.sn7498_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7498_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7519 "stats.sn7519_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7519_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7557 "stats.sn7557_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7557_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7648 "stats.sn7648_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7648_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7677 "stats.sn7677_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7677_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7715 "stats.sn7715_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7715_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7743 "stats.sn7743_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7743_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7773 "stats.sn7773_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7773_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7790 "stats.sn7790_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7790_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7805 "stats.sn7805_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7805_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7836 "stats.sn7836_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7836_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7850 "stats.sn7850_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7850_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7853 "stats.sn7853_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7853_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7874 "stats.sn7874_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7874_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7901 "stats.sn7901_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7901_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7946 "stats.sn7946_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7946_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          7990 "stats.sn7990_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn7990_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          8127 "stats.sn8127_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn8127_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          8149 "stats.sn8149_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn8149_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          8211 "stats.sn8211_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn8211_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          8303 "stats.sn8303_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn8303_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          8318 "stats.sn8318_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn8318_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          8425 "stats.sn8425_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn8425_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          8453 "stats.sn8453_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn8453_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          8477 "stats.sn8477_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn8477_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          8520 "stats.sn8520_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn8520_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          8616 "stats.sn8616_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn8616_REML+tlrc.HEAD[29]" \
          8636 "stats.sn8636_REML+tlrc.HEAD[28]" \
               "stats.sn8636_REML+tlrc.HEAD[29]" \
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Edited 1 time(s). Last edit at 08/23/2012 01:04PM by Peter Molfese.

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Subject	Author	Posted
3dMEMA error	Patrick Bedard	May 17, 2012 10:25AM
Re: 3dMEMA error	Gang Chen	May 17, 2012 04:49PM
Re: 3dMEMA error	Patrick Bedard	May 21, 2012 04:04PM
Re: 3dMEMA error	Peter Molfese	August 23, 2012 11:18AM
Re: 3dMEMA error	ziad	August 23, 2012 12:59PM
Re: 3dMEMA error	Peter Molfese	August 23, 2012 01:04PM
Re: 3dMEMA error	Peter Molfese	August 29, 2012 11:50AM
Re: 3dMEMA error	ziad	August 29, 2012 06:20PM