Hi Rick,
Thank you for this. I fixed the b-indexing, as well as changing the file names. However, if I run this script:
3dANOVA2 -type 3 -alevels 6 -blevels 18 \
-dset 1 1 p101_DN+tlrc \
-dset 2 1 p101_DW+tlrc \
-dset 3 1 p101_DL+tlrc \
-dset 4 1 p101_LN+tlrc \
-dset 5 1 p101_LW+tlrc \
-dset 6 1 p101_WN+tlrc \
-dset 1 2 p03_DN+tlrc \
-dset 2 2 p03_DW+tlrc \
-dset 3 2 p03_DL+tlrc \
-dset 4 2 p03_LN+tlrc \
-dset 5 2 p03_LW+tlrc \
-dset 6 2 p03_WN+tlrc \
-dset 1 3 p04_DN+tlrc \
-dset 2 3 p04_DW+tlrc \
-dset 3 3 p04_DL+tlrc \
-dset 4 3 p04_LN+tlrc \
-dset 5 3 p04_LW+tlrc \
-dset 6 3 p04_WN+tlrc \
-dset 1 4 p05_DN+tlrc \
-dset 2 4 p05_DW+tlrc \
-dset 3 4 p05_DL+tlrc \
-dset 4 4 p05_LN+tlrc \
-dset 5 4 p05_LW+tlrc \
-dset 6 4 p05_WN+tlrc \
-dset 1 5 p06_DN+tlrc \
-dset 2 5 p06_DW+tlrc \
-dset 3 5 p06_DL+tlrc \
-dset 4 5 p06_LN+tlrc \
-dset 5 5 p06_LW+tlrc \
-dset 6 5 p06_WN+tlrc \
-dset 1 6 p07_DN+tlrc \
-dset 2 6 p07_DW+tlrc \
-dset 3 6 p07_DL+tlrc \
-dset 4 6 p07_LN+tlrc \
-dset 5 6 p07_LW+tlrc \
-dset 6 6 p07_WN+tlrc \
-dset 1 7 p08_DN+tlrc \
-dset 2 7 p08_DW+tlrc \
-dset 3 7 p08_DL+tlrc \
-dset 4 7 p08_LN+tlrc \
-dset 5 7 p08_LW+tlrc \
-dset 6 7 p08_WN+tlrc \
-dset 1 8 p09_DN+tlrc \
-dset 2 8 p09_DW+tlrc \
-dset 3 8 p09_DL+tlrc \
-dset 4 8 p09_LN+tlrc \
-dset 5 8 p09_LW+tlrc \
-dset 6 8 p09_WN+tlrc \
-dset 1 9 p10_DN+tlrc \
-dset 2 9 p10_DW+tlrc \
-dset 3 9 p10_DL+tlrc \
-dset 4 9 p10_LN+tlrc \
-dset 5 9 p10_LW+tlrc \
-dset 6 9 p10_WN+tlrc \
-dset 1 10 p11_DN+tlrc \
-dset 2 10 p11_DW+tlrc \
-dset 3 10 p11_DL+tlrc \
-dset 4 10 p11_LN+tlrc \
-dset 5 10 p11_LW+tlrc \
-dset 6 10 p11_WN+tlrc \
-dset 1 11 p14_DN+tlrc \
-dset 2 11 p14_DW+tlrc \
-dset 3 11 p14_DL+tlrc \
-dset 4 11 p14_LN+tlrc \
-dset 5 11 p14_LW+tlrc \
-dset 6 11 p14_WN+tlrc \
-dset 1 12 p15_DN+tlrc \
-dset 2 12 p15_DW+tlrc \
-dset 3 12 p15_DL+tlrc \
-dset 4 12 p15_LN+tlrc \
-dset 5 12 p15_LW+tlrc \
-dset 6 12 p15_WN+tlrc \
-dset 1 13 p16_DN+tlrc \
-dset 2 13 p16_DW+tlrc \
-dset 3 13 p16_DL+tlrc \
-dset 4 13 p16_LN+tlrc \
-dset 5 13 p16_LW+tlrc \
-dset 6 13 p16_WN+tlrc \
-dset 1 14 p17_DN+tlrc \
-dset 2 14 p17_DW+tlrc \
-dset 3 14 p17_DL+tlrc \
-dset 4 14 p17_LN+tlrc \
-dset 5 14 p17_LW+tlrc \
-dset 6 14 p17_WN+tlrc \
-dset 1 15 p18_DN+tlrc \
-dset 2 15 p18_DW+tlrc \
-dset 3 15 p18_DL+tlrc \
-dset 4 15 p18_LN+tlrc \
-dset 5 15 p18_LW+tlrc \
-dset 6 15 p18_WN+tlrc \
-dset 1 16 p19_DN+tlrc \
-dset 2 16 p19_DW+tlrc \
-dset 3 16 p19_DL+tlrc \
-dset 4 16 p19_LN+tlrc \
-dset 5 16 p19_LW+tlrc \
-dset 6 16 p19_WN+tlrc \
-dset 1 17 p20_DN+tlrc \
-dset 2 17 p20_DW+tlrc \
-dset 3 17 p20_DL+tlrc \
-dset 4 17 p20_LN+tlrc \
-dset 5 17 p20_LW+tlrc \
-dset 6 17 p20_WN+tlrc \
-dset 1 18 p21_DN+tlrc \
-dset 2 18 p21_DW+tlrc \
-dset 3 18 p21_DL+tlrc \
-dset 4 18 p21_LN+tlrc \
-dset 5 18 p21_LW+tlrc \
-dset 6 18 p21_WN+tlrc \
-amean 1 DW \
-amean 2 DL \
-amean 3 DN \
-amean 4 LW \
-amean 5 LN \
-amean 6 WN \
-adiff 1 2 DW_DN \
-adiff 1 3 DL_DN \
-adiff 4 5 LW_LN \
-adiff 3 5 DN_LN \
-adiff 3 6 DN_WN \
-adiff 4 6 LN_WN \
-fa FtestlevelA \
-bucket grp2anova_blk_evt
I still get the following error:
** ERROR: Unrecognized command line option: 1
Here's hoping these excerpts from '3dANOVA2 -help' enlighten:
'(1) chocolate, (2) glazed, (3) sugar'
'(1) fred, (2) ethel, (3) lucy, (4) ricky'
'-dset 1 1 filename : data set for level 1 of factor A'
I'm having trouble figuring out using gen_group_command.py, because there are 6 levels for each participant. Do you have any advice for trying this method?
Thank you so much.
